收评节后首日迎开门红沪指放量涨168 http://www.kaimenhonga.com/kmhsp/5583.html相信很多朋友都对NCI-60全基因组计划有一些基本的了解。NCI-60是美国肿瘤研究推出的作为肿瘤研究标准模型的60种细胞株。自建立之处（年）开始各种芯片，测序都对这些细胞株进行过测试。此外各种肿瘤相关的药物也基本上会首先对着60种细胞中进行测试，为此这60种细胞株对各种药物的反应也都有数据进行支持。那么CellMiner是什么呢“？CellMiner是一个数据库，提供了NCI-60所有细胞的基因组数据：包括原始数据，中等分析水平数据和高等分析水平的数据。所谓高等分析水平，就是综合了多种数据类型，比如CNV，甲基化和表达数据三种类型的分析结果。可以说CellMiner是NCI-60各种数据整合最全的数据库。
这幅图就是CellMiner的主页截图，虽然丑，但是内容非常丰富。
想要对这60种肿瘤细胞株进行分析的生物学家们，可以进行下载进行多种观察了。此外NCI60细胞株也已经有大量的相关数据在10年都已经发表，包括核型等。
基于NCI-60表达谱及甲基化数据，对相关的GO和pathway分析可以得到非常好的细胞生物学结论，下图即为前几天发表在CancerResearch上应用CellMiner分析的一个结果。
此外同样利用0表达谱及甲基化数据，我们可以发现很多基因的表达明显主要受CNV调控，还有另外一批基因主要受DNA甲基化调控，当然大多数基因同时受DNA甲基化和CNV的双重调控。
当然了这些都是初步的挖掘，更多的idea都可以产生，然后利用NCI60或者整合更多的data进行论证。
你知道利用公共数据库那些科研工具需要掌握吗？看看大家怎么看的吧！
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