甲基化指的是基因的修饰,然后这个基因就不表达了,在过去几十年是非常火的领域,那么怎么来结合这个概念,跟上免疫的潮流呢?
1.研究背景
肿瘤突变负荷(TMB)和拷贝数是预测病人免疫治疗发应的预测标志物,之前的研究表明,有丝分裂和TMB、拷贝数以及发生在PMD区域的低甲基化水平相关,之前已经有很多研究探索了免疫治疗反应和TMB以及拷贝数特征的关系,但很少有研究去探究甲基化水平的缺失和免疫治疗反应的关系。
其中,部分甲基化结构域(PMD)是基因组的一个延伸区域,在该区域表现出了降低的平均DNA甲基化水平,PMD主要集中在那些编码基因很少或者是转录失活的区域。LINE是长散在重复序列(longinterspersednuclearelements,LINE),意为散在分布的长细胞核因子,是散在分布在哺乳动物基因中的一类重复序列,这种重复序列较长,本文通过LINE-1探针中甲基化表达的平均值用来衡量一个病人的整体去甲基化表达水平。
在本篇研究中,HyunchulJung等人将