双十一来了,优惠力度大
这位会员厉害呀,发了4.8分的SCI
看完这篇文章,你还会觉得SCI难吗
SCI狂人团队VIP会员
有些人留言喜欢纯生信数据挖掘套路,有些留言喜欢生信+实验验证套路,上一次分享了纯生信,所有这次我们分享生信(GEO数据库)+实验验证3分+套路。作者的研究思路如下:
研究简介:
外伤性脑损伤(TBI)后继发性脑损伤的确切机制仍不清楚;因此,确定参与TBI的关键分子机制至关重要。mRNA表达微阵列GSE从基因表达综合库(GEO)下载。GSE总共包括31个大脑皮层样本,其中包括两个TBI后时间点。该微阵列具有从TBI后4小时起的八个对照和七个TBI样品,以及从TBI后24小时起的八个对照和八个TBI样品。在这项基于生物信息学的研究中,分别在TBI后4小时和24小时在Sprague-Dawley(SD)大鼠TBI模型中鉴定了和66个差异表达基因(DEG)。功能富集分析表明,已鉴定的DEGs在几个方面显着富集,例如核因子-κB转录因子活性的正向调节,丝裂原激活的蛋白激酶信号传导途径,凋亡过程的负向调节和肿瘤坏死因子信号传导途径。此外,具有高连接度的集线器基因主要与炎症介质有关。为了验证前五个枢纽基因,使用失重法建立了TBI大鼠模型,并对大脑皮层进行了实时定量聚合酶链反应分析。结果显示,与对照组大鼠相比,TBI大鼠中Tnf-α,c-Myc,Spp1,Cxcl10,Ptprc,Egf,Mmp9和Lcn2上调,而Fn1下调。在这些中心基因中,Fn1,c-Myc和Ptprc可能代表TBI的新生物标记或治疗靶标。这些确定的途径和关键基因可以提供对TBI分子机制的见识,并为TBI患者提供潜在的治疗靶标。该研究已于年1月获得中国医院实验动物伦理委员会批准(批准号)。
文章内容:
1、GEO数据下载,差异分析
2、GO、KEGG、PPI分析,筛选hub基因
3、实验验证hub基因的表达
生信文章好不好发不重要,重要的就是需要我们多动手,多尝试,如果不动手,不进行尝试,永远都是0机会。
往期内容:
纯生信单基因独立预后发文思路3+
作为研究生,这种情况需不需要“报恩”
看完这篇非肿瘤的生信数据挖掘,你还会觉得难吗
单位取消论文奖励,但是老板奖励我1万
这个期刊太nice了,这样的文章都敢接收
这篇文章太厉害了,只用一张列线图就发表了
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