今天介绍的文章是新发表在《PlantPhysiology》上，日本科学家构建的植物进化关系数据库并发表的题为《Gcornplant:adatabaseforretrievingfunctionalandevolutionarytraitsofplantgenes》的文章。
基因同源性有助于我们了解基因功能和物种形成。在公共数据库中登记的植物基因和物种的数量不断增加。将各种植物的同源基因结合起来以更好地理解植物物种形成是十分有用的。
作者设计了Gcornplant数据库，用于检索感兴趣的植物基因的同源性和进化信息。从RefSeq数据库获得73种（62种陆生植物和11种绿藻）的氨基酸序列，共含有个序列。基于这些序列之间的BLAST搜索，将同源基因分组在不同同源性指数阈值处。为了显示目的基因的功能和进化特征，描绘了连接具有高同源性指数的基因的系统发育树，以及具有各种同源性指数的基因数目的折线图。此外，这些指数投射在网络图上，其中研究的物种基于同源基因的比例连接，并且基于NCBI分类法的物种的系统发育树。
Gcornplant提供了各种虚拟时间点的同源基因信息以及植物中的物种形成。Gcornplant是一个可供学术使用的开放式数据库，网址为